La reacción en cadena de la polimerasa (PCR) está validada para el diagnóstico de Mycobacterium tuberculosis sólo en muestras respiratorias con baciloscopia positiva. En muestras con baciloscopia negativa, la sensibilidad es variable.
La PCR para detección de tuberculosis se realiza sobre el ADN purificado directamente de los especímenes clínicos, sin necesidad de realizar un cultivo. Pueden analizarse muestras de expectoración, lavados bronquiales, jugo gástrico, derrames pericárdicos, derrames pleurales, líquido de ascitis, líquido cefalorraquídeo, orina y en general de casi cualquier fluido o tejido corporal donde se sospeche que se encuentra la bacteria.
La sensibilidad de la PCR en estos especímenes es del 83-94%,
la especificidad del 98-100%,
el valor predictivo positivo es de 86-100% y
el valor predictivo negativo de 96-98% comparados con el diagnóstico por cultivo.
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